道路与铁道工程系是北京交通大学最传统的优势特色系所，其前身是1956年成立的北京铁道学院铁道建筑系。主要承担道路和铁道工程领域的规划、勘测、设计、施工及环境保护等的研究及人才培养任务。以铁路及城市轨道交通轨道结构、线路设计理论与技术、铁路工程灾害监测与治理、特殊土路基设计理论与技术研究等为特色，下设线路设计、轨道结构、路基路面、地质工程、测量工程和城市轨道交通等6个研究室。

本系汇集了我国铁道、道路领域的优秀人才，入选了国家创新人才推进计划重点领域创新团队。包含12名教授、23名副教授，其中长江学者2人、“科技北京”百名领军人才1人、北京市科技新星3人,詹天佑铁道科技大奖和成就奖2人，茅以升铁道科技奖2人、享受国务院政府特殊津贴2人；同时还聘有3名院士作为兼职教授和学术顾问。

本系1961年开始招收铁道建筑方向研究生，道路与铁道工程学科1981年获硕士学位授权，1990年获博士学位授权，2007年成为国家重点学科。为本科生、研究生等开设多门课程。设有交通运输工程博士后科研流动站。同时还在交通运输、建筑与土木工程领域设有2个工程硕士点。铁道工程专业为国家级一流本科专业，培养以轨道交通工程设计、施工及运营管理为鲜明特色，具有国际视野和创新潜力的行业领军人才。

近年本系来取得了一系列标志性成果：提出了列车-轨道-线下基础动力学分析理论及动力选线技术体系；建立了复杂环境下高速铁路路基、无砟轨道及无缝线路设计理论与方法；形成了临近铁路施工检测、风险评估与控制关键技术；建立了高速铁路线路工程安全服役监测理论与技术等。团队承担国家自然基金、国家重点研发计划项目等20余项，省部级重大、重点课题40余项，年均科研经费达3000万元；发表论文500余篇，专著13部，获专利80余项。获国家级奖3项、省部级奖12项，其中双主持项目获国家科技进步一等奖1项，研究成果入选2013年中国高校十大科技进展等。创办并成功举办5届铁道工程关键技术国际学术会议（ICRE）。